Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms