Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOPBP1Q92547 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms