Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2Q8WUA4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C2Q8WUA4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms