Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2AF1L4Q8WU68 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms