Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00116Q8NCU8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms