Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB4Q86W47 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms