Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms