Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms