Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms