Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms