Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms