Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATAD3CQ5T2N8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms