Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms