Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA9Q16790 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CA9Q16790 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CA9Q16790 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CA9Q16790 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CA9Q16790 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CA9Q16790 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CA9Q16790 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CA9Q16790 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CA9Q16790 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CA9Q16790 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CA9Q16790 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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