Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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