Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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