Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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