Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms