Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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