Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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TRIP13Q15645 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRIP13Q15645 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRIP13Q15645 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms