Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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