Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms