Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPSQ13938 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms