Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PTCH1Q13635 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PTCH1Q13635 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTCH1Q13635 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTCH1Q13635 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTCH1Q13635 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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