Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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