Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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