Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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