Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRQ13535 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATRQ13535 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRQ13535 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRQ13535 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRQ13535 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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