Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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