Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME3Q13232 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME3Q13232 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms