Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RESTQ13127 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RESTQ13127 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RESTQ13127 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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