Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
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