Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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