Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms