Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRDNQ13061 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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