Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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