Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms