Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms