Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD51Q06609 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms