Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms