Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms