Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OC90Q02509 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms