Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms