Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTD2P86397 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTD2P86397 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTD2P86397 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTD2P86397 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms