Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms