Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms