Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms