Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1P60507 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1P60507 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms