Protein–RNA interactions for Protein: P60468

SEC61B, Protein transport protein Sec61 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61BP60468 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SEC61BP60468 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SEC61BP60468 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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