Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROK1P58294 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROK1P58294 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROK1P58294 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROK1P58294 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROK1P58294 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROK1P58294 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms